第29集劇情亮點:
秦川被楊雄和金明海的誠心打動，決定留下來徹查清江兩案，並請來100多名專家和技術人員加入專案組。面對齊煥生案現場被破壞的情況，秦川提出三個查案方向，決心利用新技術對陳年舊案進行徹底清理。他堅信有志者事竟成，得到了省廳副廳長袁震的全力支持。
金明海在達到退休年齡後仍堅持留在清江刑偵支隊，希望親眼看到凶手伏法；楊雄也請求留下繼續偵破案件。他們與返回的顧文龍一起，在專案組辦公室宣誓，表達了對偵破案件的堅定決心。金明海還帶秦川前往邱志國家調查，發現案件可能涉及財產侵奪，但具體原因存在爭議。
郭嘉琦和劉林討論認為四連指指紋是破案關鍵，郭嘉琦克服耳疾復發的影響，決心全力以赴。秦川有踱步思考的習慣，而郭嘉琦和劉林則密切關注秦川的動向，準備隨時交流案情進展。武英德雖遺憾未能親自破案，但他將多年整理的資料全部交給了秦川，為案件偵破提供了寶貴的線索。
邱行長和齊副所長被殺的案子懸了十六年，因為現場留下的證據太少，秦川找來武英德和曹忠恕等人幫忙，他發誓要查出真兇。
金明海送走楊雄後，把專案組辦公室收拾得整整齊齊。沒想到楊雄又回來了，他想留在清江刑偵支隊，繼續查那兩個案子，還想保留專案組。2008年，顧文龍從警校畢業分到清江刑偵支隊，他按照規矩去專案組辦公室宣誓。
金明海找秦川幫忙偵破清江那兩起案子，他本來該退休了，但還是留了下來，就想親眼看到凶手被抓。楊雄也求秦川留在清江查案，秦川被他們打動，讓郭嘉琦退了機票，決定要把案子查清楚。
齊煥生被害的現場被破壞了，楊雄和金明海就帶秦川去了邱志國家，那裡還保持著原樣。蔣繼忠也趕了過來，感謝秦川幫忙，他遺憾自己退休前沒破這個案子，只想在有生之年找到真兇。秦川發誓會全力以赴。
秦川晚上睡不著，和郭嘉琦商量著用新技術清理陳年舊案。郭嘉琦擔心破不了案會被人說閒話，秦川卻覺得有志者事竟成。偵查員劉林他們整理了積壓的案子，秦川讓他挑出殘害婦女兒童的案子，然後向省廳副廳長袁震匯報了情況，說了查案思路，袁震很支持。
秦川順路去看望武英德，武英德聽說他接了清江那兩起案子，遺憾自己沒破。但他很高興清江的辦案人員一直熱心此案，從不放棄。武英德把當年查案的資料都給了秦川，秦川特別珍惜，這是武英德多年的心血。秦川還請了一百多個專家和技術人員加入專案組，曹陽和蘇暢也在裡面。
楊雄和金明海親自去接秦川和專家組成員，秦川立馬開了案情分析會。楊雄和金明海拿出這些年搜集的線索，顧文龍覺得那兩起案子是報復，武英德卻認為是搶錢。金明海在邱志國家發現少了兩千塊現金，覺得凶手是搶錢。但楊雄有不同看法，邱志國夫婦的身份證不見了，凶手卻沒拿身份證去取錢。兩人意見不合，爭得不可開交。秦川趕緊打斷他們，提出了三個查案方向。
郭嘉琦和劉林住一起，討論案情時都覺得那個四連指指紋很重要。郭嘉琦之前在偵破清江爆炸案時耳疾復發退了出來，這次他下定了決心要好好乾。他特意坐在窗前吃方便面，就等著秦川出來散步。秦川有個習慣，喜歡在走廊來回走，思考案情。後來，郭嘉琦和劉林下樓去找秦川了。
第30集劇情亮點:
- 秦川決定重新審視清江兩案，親自帶隊檢查現場，並召開案情分析會提出犯罪嫌疑人可能是本地人的觀點，建議集中警力採集指紋。
- 東林縣2010年發生的殺人案中，三個小女孩在廢棄窯洞中被發現死亡，初步判斷是窒息而死且生前遭受性侵害，案件成為省廳的重點督辦案件，陶維志六年來一直在尋找線索。
- DNA證據在案件偵破中起到關鍵作用，包括確認犯罪行為由一人所為，以及後來通過與顧家人的DNA匹配找到了可能的犯罪嫌疑人。
- 儘管偵查團隊付出了巨大努力，如加班加點檢測證據、對可疑人員進行審訊和DNA檢測，但在案件初期並未找到有價值的DNA或指紋等直接證據。
專案組首先查東林那起積壓了四年的殺人案，死者是三個女孩子，東林刑偵隊長陶維志忙活了四年也沒有任何進展，他急得一籌莫展。
秦川半夜失眠，在院子長廊散步。郭嘉琦和劉林知道他在為清江兩案犯愁，就來找他商量。秦川看出辦案人員十八年來都很努力，但意見不統一。他決定從現場查起，重新核驗證物。
第二天早上，楊雄帶著秦川和專家來到邱志國家。雷修平和曹忠恕再次接手此案，他們仔細排查現場，曹陽和蘇暢等人也不敢大意，仔細檢查每個細節。曹陽和蘇暢加班加點檢測證據。
楊雄、金明海和顧文龍在辦公室等結果，等了好久不見人，就去實驗室找他們，還帶了飯菜。可惜蘇暢和曹陽仔細檢驗後，沒找到有價值的DNA和第二枚指紋，楊雄他們很失望，但還是安慰了蘇暢和曹陽。
秦川召開案情分析會，認為這案子是侵財，犯罪嫌疑人是本地人。他還闡述了自己的想法，楊雄和顧文龍都點頭同意。秦川建議集中警力採集指紋，郭嘉琦和劉林都很贊同。秦川讓郭嘉琦留在清江搜集指紋，他帶劉林和曹陽去林城市東林縣查另一樁殺人案。
曹忠恕的工作結束，要回省城。曹陽送他時，發現他吃藥，很擔心他的身體。曹忠恕找借口掩飾，還叮囑曹陽好好跟著秦川。楊雄一早來送秦川，帶了家鄉特產。
林城市東林縣刑偵支隊的陶維志聽說秦川來查案，他正在坪城等證物。他打電話向蘇暢打聽行程。秦川聽說陶維志六年來一直在找線索，很好奇，讓劉林和蘇暢介紹案情。
東林殺人案發生在2010年4月19日，三個小女孩去河裡抓小蝌蚪，晚上十點還沒回家。家裡人找了好久，最後在山上廢棄的窯洞裡找到她們的屍體。省廳很重視，列為重點督辦案件。
劉林、蘇暢和雷修平一早到案發現場，林城市公安局副局長鍾志明早就在等。他從市局調來六個精兵強將，東林縣委書記親自指揮，全縣警力都投入此案。
方文局長、DNA實驗室主任嚴軍、刑偵大隊大隊長楊威和成樹峰忙到天亮，提取證物，屍檢後初步判斷是窒息而死，生前遭受性侵害。
嚴軍說現場有五個飲料瓶，其中三個裝有蝌蚪，是三個受害者的。還有兩個煌山牌香煙菸蒂，DNA和三個女孩身體裡殘留物的一樣，確定是一個人作案。楊威和成樹峰分別說了調查的證據，犯罪嫌疑人在4月18日下午遇到三個小女孩，性侵後勒死，藏在廢棄窯洞。
陶維志匆匆趕來要照片，楊威不耐煩地打發他。陶維志不甘心，他聽蘇暢說要靠DNA找凶手，不相信僅靠這個就能找到。
偵查員找到一個老光棍很可疑，陶維志立刻去審訊。劉老根拒不認罪，蘇暢建議做DNA檢測。陶維志徵得領導同意後安排檢測，結果不是他所為。陶維志第一次見識了這種技術。
蘇暢對村里血型相同的年輕男子進行了好幾輪DNA檢測，都沒找到犯罪嫌疑人。陶維志不放棄，四處走訪調查，忙了四年也沒結果。2014年，他看到電視裡考古專家查到曹操家族DNA的新聞，眼前一亮，打電話向蘇暢求助。曹陽推薦了在餘河刑偵支隊的同學王然，陶維志立刻去餘河找王然。王然很快查到顧家的人和犯罪嫌疑人的DNA吻合。
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